28 Jul Nueva empresa israelí mapea genoma de algodón y camote para mejores cosechas
El software de NRGene muestra la composición genética de los organismos para encontrar las semillas más resistentes
Campo de algodón (CC BY Mike Beauregard, Flickr)
NRGene, la nueva empresa israelí que ha mapeado el genoma del pan, la pasta y el trigo silvestre, dijo que ahora ha mapeado el genoma del tipo más común del algodón y del camote, dando a los investigadores información crítica para desarrollar plantas más sanas con mayores rendimientos.
NRGene dijo que se asoció con Genosys Inc. (TGS Singapur), distribuidor de las tecnologías genómicas en China, para ensamblar la composición del genoma de algodón Upland, el algo-dón más común usado para ropa, en menos de siete semanas. Un esfuerzo similar tomaba años y costaba muchos millones de dólares, dijo la compañía.
El algodón de Upland constituye el 90 por ciento del algodón cultivado en todo el mundo y se utiliza para producir la mayor parte de la ropa, dijo la compañía.
También se mapeó la composición genómica de Gossypium barbadense, también conocido como algodón extra largo, que se utiliza en tejidos de algodón de lujo, informó la compañía en un comunicado.
El Director General de NRGene, Gil Ronen (Cortesía)
«El algodón es uno de los cultivos agrícolas no alimentarios más importantes del mundo», dijo el gerente general de NRGene, Gil Ronen, en un comunicado. «Al brindar información crítica sobre su composición, estamos ayudando a los investigadores a desarrollar plantas más saludables con mayores rendimientos y que requieren menos recursos».
Los desarrolladores de semillas de todo el mundo gastan miles de millones de dólares y años para desarrollar nuevas variedades de semillas, más nutritivas y resistentes. Estos, a su vez, permiten a los agricultores sembrar mayores cantidades de cultivos más nutritivos y más resistentes. Esto es crucial para un mundo que tendrá que alimentar y vestir a unas 9.700 millones de personas en 2050. Se espera que la demanda mundial de alimentos aumente por lo menos un 20 por ciento en los próximos 15 años, según un informe del Banco Mundial de mayo de 2017.
Los genomas contienen toda la composición genética de los organismos, ya sean seres humanos, plantas, animales o bacterias. Al estudiar los genomas de las plantas para deter-minar qué semillas se adaptarán mejor a las condiciones climáticas y que tendrán una alta elasticidad, los desarrolladores pueden ahorrar mucho tiempo y dinero y participar en una agricultura más eficiente.
El montaje del genoma del camote se entregó a un grupo de científicos de Japón, China y Corea y fue parte de un proyecto para investigar la composición del camote.
«El camote es un cultivo esencial para las comunidades del mundo, especialmente en Asia y África, proporcionando alto contenido de vitaminas, minerales y calorías», dijo el profesor Qingchang Liu de la Universidad Agrícola de China, que formó parte del consorcio para estudiar la dulce raíz de almidón. «Por lo tanto, lanzamos un proyecto internacional de secuenciación del genoma del camote”.
El camoteproporcionan alto contenido en vitaminas, minerales y calorías (Melanie Lidman / Times of Israel)
El montaje del genoma del camote (Ipomoea batatas) tardó menos de dos meses utilizando la tecnología desarrollada por la firma estadounidense Illumina Inc., desarrolladora de tecnología para la investigación genómica, y el software de NRGene.
«Los avances en la investigación genética en los últimos dos años son sorprendentes», dijo Ung-Han Yoon de la Administración de Desarrollo Rural de Corea. «Anteriormente, trabajamos durante años para ensamblar genomas. Ahora la tecnología de NRGene puede entregar datos esenciales sobre cultivos críticos, como el camote, en sólo cuestión de semanas, a una fracción del costo».
El equipo internacional de investigación está estudiando la creación de un pan-genoma de camote, que permitirá a los investigadores ver rasgos únicos y compartidos entre todas las variedades de la raíz y luego criar camotes con mayores valores nutricionales, productividad y resistencia a las enfermedades.
El pan-genoma será analizado utilizando una de las herramientas de software de NRGene, que capta la diversidad de especies y permite la creación de un cuadro genómico completo que permita un análisis comparativo de múltiples variedades.
«Con el genoma y en última instancia el análisis pan-genoma, los criadores pueden desarrollar variedades más nutritivas, de alto rendimiento con menos recursos necesarios», dijo Ronen de NRGene.
NRGene, con sede en Ness Ziona, Israel, es una empresa genómica de grandes datos que desarrolla software y algoritmos para revelar la composición genómica y la diversidad de plantas de cultivo, animales y organismos acuáticos que ayudan a apoyar los programas de mejoramiento genético. El software de NRGene está siendo utilizado por algunas de las principales compañías de semillas de todo el mundo, incluyendo Monsanto Company y Syngenta, así como equipos de investigación en el mundo académico.
Establecida por Ronen y Guy Kol en 2010, la compañía reclutó descifradores de códigos de la unidad 8200 del ejército israelí y los hizo escribir algoritmos que harían el trabajo de descifrar genomas. El conjunto de herramientas computacionales que desarrollaron, junto con ingenieros de software y bioinformáticos, permiten a NRGene mapear genomas complejos de forma rápida y precisa.
Fuente: The Times of Israel
Traducción: Consulado General H. de Israel en Guayaquil
